Nous allons désormais traiter des arguments contre le clonage. Très nombreux, ils sont à l'origine des perpétuelles remises en cause et débats, qui soulèvent le problème de l'éthique. Mais, avant tout, qu'est-ce que l'éthique ?
Synonyme de morale, l'éthique regroupe l'ensemble des principes de jugement et de conduite qui s'imposent à la conscience individuelle ou collective et qui sont fondés sur les impératifs du bien.
●Le premier reproche que l'on pourrait faire au clonage se ramène à l'aspect éthique de ses avantages. Prenons l'exemple d'un clonage qui a pour objectif de créer un être parfait. Si la science est sous l'emprise d'une idéologie (par exemple, le nazisme), cela serait assurément une forme d'eugénisme, mais cela condamnerait surtout notre diversité.
●On sait aussi que de nombreux jumeaux ont des difficultés à trouver leur propre identité. Un clone aurait alors encore plus de peine à y parvenir puisqu'il ne serait finalement qu'une copie, ce qui lui supprime toute particularité voire individualité. Cela poserait donc un réel problème psychologique chez les individus clonés.
●De plus, la création d'un clone serait un procédé très couteux qui ne serait pas accessible à tous ce qui engendrerait encore des disparités et constiturait une autre forme de sélection.
●Le clonage permettrait de sélectionner des caractéristiques génétiques prédéterminées, qui nous donnerait l'occasion de choisir le physique, le caractères ainsi que les dons de notre futur enfant. Or, ces caractéristiques sont le fruit du hasard dans la reproduction sexuée, c'est elle qui nous permet d'être différents les uns des autres. Le clonage irait à l'encontre de la biodiversité, des mécanismes de l'évolution de la vie et ferait perdre toute filiation, ce qui est essentiel au sujet humain. Tout ceci correspond au clonage reproductif et représente un boulversement considérable de la condition humaine, particulièrement de la sexualité et de la procréation.
●Le clonage, avec tous les enjeux qu'il représente, pourrait aussi entraîner de nombreux "dérapages" car tout le monde voudrait contrôler cette technique. Cela deviendrait un enjeu économique très important, qui serait comparable à n'importe quel autre commerce et nous ne pourrions alors plus le maîtriser rééllement. Des femmes seraient tenter de vendre leurs ovules, ou bien de jouer le rôle de mères-porteuses ; elles seraient en quelques sortes des cobayes et l'Homme serait instrumentalisé.
●Face à la loi, le clonage est contraire au droit à l'identité individuelle, il porte atteinte aux droits de la personne (les principes fondamentaux de parité et d'égalité, de même que celui de non-discrimination sont violés). Un clone n'aurait pas le statut d'être humain ; il appartiendrait à la science ou pire à d'autres Hommes, ce qui constitue une forme d'esclavage.